基组词语词
㈠ gaussian的基组的星号和加号是什么意思
用iop(3/24=1)可以显示每个原子实际用的基组,检查是否设对了;也可以用GFPrint关键词输出相似内回容,但没那么清楚;答也可以用GFInput关键词来输出实际所用基组,这些信息可以直接作为基组输入的信息。
㈡ 离子中不同的原子用不同的基组的gaussian输入文件怎么写
(1)对于不同的原子使用不同的基组,可以采用原子编号代替原子来定义。(版2)对于那些看似复杂的权基组可以从一些网站上获得(选Gaussian基组,再选元素),就可以获得用iop(3/24=1)可以显示每个原子实际用的基组,检查是否设对了;也可以用GFPrint关键词输出相似内容,但没那么清楚;也可以用GFInput关键词来输出实际所用基组,这些信息可以直接作为基组输入的信息。
㈢ 关于基组的成语
基 成语 :
开基立业来、源
墙高基下、
积基树本、
开基创业
开基创业 [kāi jī chuàng yè]
生词本
基本释义
指开创帝业。
褒义
出 处
明·罗贯中《三国演义》第44回:“吾等自随孙将军开基创业,大小数百战,方才战得六郡城池。”
㈣ 高尔基的基组什么词
高尔基的复基组什么词制 : 基层、 基数、 基因、 地基、 基础、 基业、 奠基、 基石、 基价、 房基、 羟基、 基建、 根基、 宅基、 登基、 基调、 路基、 基本、 基干、 基金、 基点、 基线、 基于、 基地、 基督、 基肥、 基准、 税基、 土基、 基扃、 创基、 天基、 祖基、 基射、 基构、 基墌、 基面、 肇基、 厝基、 基波
㈤ 如何选择合适的泛函和基组的组合
《什么样的泛函和基组的组合,适合做的事情》
这些都是我自己科研经验和以前读的文献的总结。也没写什么参考文献,就是随便扯扯,这就全凭自己的经验和记忆啦,想到哪儿写到哪儿。这里面肯定有不对的,甚至有荒谬之极的东西,还请大家指正。也希望自己抛砖引玉,其他高手也讲讲自己的经验。
很少见到高手们总结自己的科研经验和阅览的文献。小卒我这个屁股上还没褪干净蛋壳的小菜鸟,只好抛出一块又丑又粗糙的破砖,引引高手们的美玉啦。
以下探讨均不涉及cluster。主要是有机化合物、以及金属离子和有机配体组建成的配合物。其计算也都是基于单个分子的计算。周期体系不在考虑之列——这是一句无奈的词句,因为我的研究方向不在此处,所以我确实没有仔细思考过它们
1分子结构、键长和键角:
对于比较轻的元素,比如CHON之类,b3lyp/6-311++g**就很优秀,如果把基组加到了aug-cc-pv?z的程度,就没什么大的必要了。有人甚至说,Cl以前的元素用6-31g就好,如果有孤对电子加个d就行了,如果带负电荷就加个弥散。
对于一些中等重量的元素,LanL2DZ或者DZVP之类的基组就不错啦,没必要加更高的机组了,加了也是浪费。Fe的LanL2DZ有人换成SDD试过,换了以后得到不同基态结果 ,千万小心使用SDD。第一行过渡金属,如果只有一个,那么6-311+g*的计算量还是可以承受的;两个及两个以上,非赝势很难算。lanl2dz和sdd都是比较好的选择。除非做单点算,否则非要上mp2算就没太大必要了。
再重一些,比如稀土,LanL2DZ就不行了,M. Dolg先生搞出来的那个基组,斯图加特RECP的-GTO占了大部分市场份额。而泛函选择上,百分之四十用的是B3LYP,百分之四十用的是B3PW91,百分之五用的是MPn族,百分之五用的是CCSD(T)族,百分之五用的是PBE族,百分之五用的是经过改进的半经验。有时候还要自己选择,是用小核赝势呢,还是大核赝势呢。听说ADF用PBE/DZPZORA处理稀土,效果也不错,但是我没用过。
有金属的时候,据说tpss不错,但是我也没用过,不敢说。
这里我要批一批我偶然见到的一个文献:Int.J.Electrochem.Sci. 2009, 4, 295-307,伊朗的一群人做的工作。他们居然用6-31G*计算稀土元素,这简直是扯淡,大家不要学他。
半经验方法中,处理CHNO之类的元素,AM1和PM3都不错,PM6也很好,他们可以作为我们前期粗略优化的手段。不过要注意AM1处理共轭体系不太好。有人用Sparkle/AM1和Sparkle/PM3处理稀土元素。精度并不是多么好,但是极大地减轻了计算量,可以说还是很有成效的一个工作。不过这里不探讨半经验,仅仅探讨密度泛函,所以不多说了。
一个例子:3-,我会选择B3lyp/genecp来优化其分子结构,然后用PBE1PBE/genecp来计算其电子结构。genecp对应关系如下(其实,这个混合基组有自己的专门的名字,叫做LACVP+*)
Fe 0
LanL2DZ
****
C N 0
6-31+g*
****
Fe 0
LanL2DZ
分子结构计算结果的优劣可以用有2种方法加以检验,一是与可获得的实验数据进行对照(但不要忘了实验数据本身只是接近事实,而不是准确事实的本身,因为它们仍然是有误差的),二是在优化结构的基础上计算性质,同样的,还是要拿计算结果与更为有限的性质实验测定结果(它们同样有误差)进行对照。这充分体现了人类认识自然规律的有限性——我们总是只能获得相对真理。由于现有的计算理论本身在处理相关能和相对论效应时有很多困难(理论的和实际计算上的),所以,本人的研究都不涉及重金属,而只做轻元素体系,多为生物分子体系,大量的计算实验表明DZP加弥散基组与B3LYP的结合所得的结果可靠,所以一直使用。个人的精力是有限的,无法大量进行方法的尝试与鉴别,所以,只有大量阅读文献来弥补。实际上,就轻元素物质的结构而言,6-31++G**的结果已然非常不错了,但在计算性质时不妨对基组适当选择。如前所述,因为实验有误差,所以有时实验并非一定可靠,更重要的是,有的性质的测定,实验上是不可能进行的(至少目前是如此),因而,计算怎样走在实验的前面,恐怕值得思考。
RI-DFT、RI-MP2方法,能比常规方法快一个数量级,但精度接近。此外还有RI-CCSD、RI-CCSD(T)等,不过用得很少。Gaussian 0x的话可以试试纯GGA+密度拟合,不会比ADF的同类方法差太多。
2氢键
氢键的计算,还是以b3lyp、b97-?、pwb6k、b2plyp、b3p86、pbe1pbe、mpw1k这几族泛函比较好。基组的话,还是aug-cc-pv?z、mg3s好一些。其实劈裂价键基组也不错,但是必须加“大弥散”和“高角动量”,因为氢键还是比较弱一些,氢键对应的波函数必须加大离域程度。
其实氢键还算是一个比较好算的东西。流行的DFT中,除了OLYP和O3LYP之外,基本都有一定精度。氢键的计算,基组的选择影响大一些,大弥散基组是必须的。
虽然dft在研究氢键方面也一直有人在用,但现在大多数的审稿人总是对这种方法持怀疑的态度,因为对扩散相互作用,dft无法预测,而审稿人更为信任的是mp2,而且一般需要大基组来计算,如aug-cc-pvdz,aug-cc-pvtz等,但如果无法完成这些基组,一些低一些的基组来做计算也是可以被接受的,如6-31G++(d,p),6-311G++(d,p)等,但bsse校正是做氢键方面一个必须要做的一部分。如aug-cc-pvdz,aug-cc-pvtz等这些大基组,bsse似乎影响不大,可以不做。
3远程弱作用
远程作用就比较扯淡了。B3交换泛函彻底完蛋。虽然我主要也是B3LYP阵营的人,但是要我在这个领域夸夸B3LYP,我还真不能瞪着眼睛说瞎话。这个领域DFTB和DFTB+曾经试图在这个领域做些贡献,但是成就并不是很大。比较成功的是DFT-D,包括b97-d,b2plyp-d等等这些加上dispersion项的DFT了。
Truhlar的泛函 M05, M05-2X, M06, M06-2X等等可能只适用于某些体系,对于有些体系,照样给出糟糕的结果。LDA居然能出乎意料地给出vdW作用,而其他GGA泛函都不行。这应该是个偶然,可能是正负误差相消的结果。比如,用LDA优化出的石墨层间距和实验值符合得相当好。PBE-D方法总是倾向于高估vdW作用。
远程作用还有别的选择——尽管它会大大增加计算量
一种选择,使用MPn,还是不够准
另一种选择,是把MPn改造成SCF-MPn,计算量忒大
再一种选择,使用CCSD(t)之类的,……呃,还是算了吧,计算量我更受不了。
文献常见的高斯09的方法有:MPW1KCIS,MPW1B95,MPWB1K,jiewei先生推荐基组tzv(2d,2p)/QZV3P。MS的话一般用GGA/PEB。
基组问题:算远程作用必须用极大的基组——这是一句废话,因为你要让两个分子相互作用,那么它们的波函必须能“够到对方”才行。从TZV(d),到TZV(d,p),到TZV(2d,2p),到TZV(2df,2pd),到TZV(3d2f,3p2d),……继续加吧,能加多高,就加多高,算远程弱作用,您永远别吝啬你的资源。当然,我绝不反对你使用DZV族
另一个选择:从6-311++g(d,p),到6-311++g(2d,p),到6-311++g(2df,2pd),到6-311++g(3df,3pd),到6-311++g(3d2f,2p2d),……继续加呀加呀加呀加!
再来个选择:从aug-cc-pvtz,到aug-cc-pvdz,到aug-cc-pvqz,……子子孙孙无穷尽也
听说过一族巨型机组,叫ANO基组,当然还有它的一些变体。ANO规模很巨大,算的能量相当精确,但是对于分子性质没有那么好的效果。
4多加一句:关于核磁,给某些人提个醒儿
昨天,有人在qq上问我,他说核磁计算结果与实验值相差太大。我问他你用啥算的?他说是b3lyp/6-31g*。我直接就无语+仆街了。
很多人习惯用6-31g*。这确实是一个很优秀的基组。但是您居然扛着6-31g*跑去算核磁,误差不达到百分之一千才怪。算核磁最小的基组,至少要用6-31++g(d,p)。这已经是最低要求了,不能再低了,建议使用6-311++g(2df,2pd)或更高
㈥ 基组什么词
“基?”的词语:
基础 基于 基本 基业 基地 基金 基调 基石 基因 基层 基准 基点 基督 基脚 基宇
基数 基源 基兆 基址 基建 基桢 基原 基祚 基扃 基命 基围 基趾 基隆 基图 基年
基干 基底 基绪 基岩 基座 基筑 基线 基坑 基墌 基面 基床 基阶 基陛 基构 基桩
基音 基级 基价 基极 基肥 基波 基频 基跱 基步 基射 基墟 基网 基团 基祸
“?基”的词语:
奠基 镃基 肇基 根基 鸿基 登基 兆基 地基 台基 丕基 元基 厝基 德基 洪基 崇基
创基 福基 兹基 承基 隆基 乾基 开基 天基 路基 刘基 国基 祖基 阶基 庆基 成基
羟基 邦基 昌基 本基 宅基 起基 墙基 门基 田基 皇基 重基 长基 阜基 垂基 道基
墉基 羧基 堂基 身基 胡基 灵基 阴基 砀基 树基 苄基 桥基 坝基 丹基 屋基 乡基
房基 砧基 硝基 山基 土基 余基 初基 烷基 诞基 盘基 税基 相基 羰基 祸基 苯基
游基 蹑基 遗基 王基 颓基
“基???”的词语:
基本建设 基本词汇 基础教育 基本矛盾 基底动脉 基本粒子
“?基??”的词语:
桑基鱼塘 开基创业 积基树本 氨基比林 开基立业 阿基米德
“??基?”的词语:
经济基础 保险基金 军事基地 生产基金 墙高基下 哈剌基酒 转氨基酶 工业基地
导弹基地 爱斯基摩
㈦ 基本的基组四字成语
开基创业
开基立业
墙高基下
积基树本
帮助别人真高兴!闪人!
㈧ 出字加个偏旁是什么字然后和基组个词语
出加上石是个础字,组成的词为 基础
㈨ 基组什么词,并造句,造少点.字
基的解释
[jī]
1. 建筑物的根脚:~石。~础。奠~。
2. 根本的,起始的:~本。~业。回~层。~点。~准。答
3. 根据:~于。
4. 化学上化合物的分子中所含的一部分子原子被看作是一个单位时,称作“基”:~团。~态。氨~。羧~。
叔叔是基层干部。