基組詞語詞
㈠ gaussian的基組的星號和加號是什麼意思
用iop(3/24=1)可以顯示每個原子實際用的基組,檢查是否設對了;也可以用GFPrint關鍵詞輸出相似內回容,但沒那麼清楚;答也可以用GFInput關鍵詞來輸出實際所用基組,這些信息可以直接作為基組輸入的信息。
㈡ 離子中不同的原子用不同的基組的gaussian輸入文件怎麼寫
(1)對於不同的原子使用不同的基組,可以採用原子編號代替原子來定義。(版2)對於那些看似復雜的權基組可以從一些網站上獲得(選Gaussian基組,再選元素),就可以獲得用iop(3/24=1)可以顯示每個原子實際用的基組,檢查是否設對了;也可以用GFPrint關鍵詞輸出相似內容,但沒那麼清楚;也可以用GFInput關鍵詞來輸出實際所用基組,這些信息可以直接作為基組輸入的信息。
㈢ 關於基組的成語
基 成語 :
開基立業來、源
牆高基下、
積基樹本、
開基創業
開基創業 [kāi jī chuàng yè]
生詞本
基本釋義
指開創帝業。
褒義
出 處
明·羅貫中《三國演義》第44回:「吾等自隨孫將軍開基創業,大小數百戰,方才戰得六郡城池。」
㈣ 高爾基的基組什麼詞
高爾基的復基組什麼詞制 : 基層、 基數、 基因、 地基、 基礎、 基業、 奠基、 基石、 基價、 房基、 羥基、 基建、 根基、 宅基、 登基、 基調、 路基、 基本、 基幹、 基金、 基點、 基線、 基於、 基地、 基督、 基肥、 基準、 稅基、 土基、 基扃、 創基、 天基、 祖基、 基射、 基構、 基墌、 基面、 肇基、 厝基、 基波
㈤ 如何選擇合適的泛函和基組的組合
《什麼樣的泛函和基組的組合,適合做的事情》
這些都是我自己科研經驗和以前讀的文獻的總結。也沒寫什麼參考文獻,就是隨便扯扯,這就全憑自己的經驗和記憶啦,想到哪兒寫到哪兒。這裡面肯定有不對的,甚至有荒謬之極的東西,還請大家指正。也希望自己拋磚引玉,其他高手也講講自己的經驗。
很少見到高手們總結自己的科研經驗和閱覽的文獻。小卒我這個屁股上還沒褪干凈蛋殼的小菜鳥,只好拋出一塊又丑又粗糙的破磚,引引高手們的美玉啦。
以下探討均不涉及cluster。主要是有機化合物、以及金屬離子和有機配體組建成的配合物。其計算也都是基於單個分子的計算。周期體系不在考慮之列——這是一句無奈的詞句,因為我的研究方向不在此處,所以我確實沒有仔細思考過它們
1分子結構、鍵長和鍵角:
對於比較輕的元素,比如CHON之類,b3lyp/6-311++g**就很優秀,如果把基組加到了aug-cc-pv?z的程度,就沒什麼大的必要了。有人甚至說,Cl以前的元素用6-31g就好,如果有孤對電子加個d就行了,如果帶負電荷就加個彌散。
對於一些中等重量的元素,LanL2DZ或者DZVP之類的基組就不錯啦,沒必要加更高的機組了,加了也是浪費。Fe的LanL2DZ有人換成SDD試過,換了以後得到不同基態結果 ,千萬小心使用SDD。第一行過渡金屬,如果只有一個,那麼6-311+g*的計算量還是可以承受的;兩個及兩個以上,非贗勢很難算。lanl2dz和sdd都是比較好的選擇。除非做單點算,否則非要上mp2算就沒太大必要了。
再重一些,比如稀土,LanL2DZ就不行了,M. Dolg先生搞出來的那個基組,斯圖加特RECP的-GTO佔了大部分市場份額。而泛函選擇上,百分之四十用的是B3LYP,百分之四十用的是B3PW91,百分之五用的是MPn族,百分之五用的是CCSD(T)族,百分之五用的是PBE族,百分之五用的是經過改進的半經驗。有時候還要自己選擇,是用小核贗勢呢,還是大核贗勢呢。聽說ADF用PBE/DZPZORA處理稀土,效果也不錯,但是我沒用過。
有金屬的時候,據說tpss不錯,但是我也沒用過,不敢說。
這里我要批一批我偶然見到的一個文獻:Int.J.Electrochem.Sci. 2009, 4, 295-307,伊朗的一群人做的工作。他們居然用6-31G*計算稀土元素,這簡直是扯淡,大家不要學他。
半經驗方法中,處理CHNO之類的元素,AM1和PM3都不錯,PM6也很好,他們可以作為我們前期粗略優化的手段。不過要注意AM1處理共軛體系不太好。有人用Sparkle/AM1和Sparkle/PM3處理稀土元素。精度並不是多麼好,但是極大地減輕了計算量,可以說還是很有成效的一個工作。不過這里不探討半經驗,僅僅探討密度泛函,所以不多說了。
一個例子:3-,我會選擇B3lyp/genecp來優化其分子結構,然後用PBE1PBE/genecp來計算其電子結構。genecp對應關系如下(其實,這個混合基組有自己的專門的名字,叫做LACVP+*)
Fe 0
LanL2DZ
****
C N 0
6-31+g*
****
Fe 0
LanL2DZ
分子結構計算結果的優劣可以用有2種方法加以檢驗,一是與可獲得的實驗數據進行對照(但不要忘了實驗數據本身只是接近事實,而不是准確事實的本身,因為它們仍然是有誤差的),二是在優化結構的基礎上計算性質,同樣的,還是要拿計算結果與更為有限的性質實驗測定結果(它們同樣有誤差)進行對照。這充分體現了人類認識自然規律的有限性——我們總是只能獲得相對真理。由於現有的計算理論本身在處理相關能和相對論效應時有很多困難(理論的和實際計算上的),所以,本人的研究都不涉及重金屬,而只做輕元素體系,多為生物分子體系,大量的計算實驗表明DZP加彌散基組與B3LYP的結合所得的結果可靠,所以一直使用。個人的精力是有限的,無法大量進行方法的嘗試與鑒別,所以,只有大量閱讀文獻來彌補。實際上,就輕元素物質的結構而言,6-31++G**的結果已然非常不錯了,但在計算性質時不妨對基組適當選擇。如前所述,因為實驗有誤差,所以有時實驗並非一定可靠,更重要的是,有的性質的測定,實驗上是不可能進行的(至少目前是如此),因而,計算怎樣走在實驗的前面,恐怕值得思考。
RI-DFT、RI-MP2方法,能比常規方法快一個數量級,但精度接近。此外還有RI-CCSD、RI-CCSD(T)等,不過用得很少。Gaussian 0x的話可以試試純GGA+密度擬合,不會比ADF的同類方法差太多。
2氫鍵
氫鍵的計算,還是以b3lyp、b97-?、pwb6k、b2plyp、b3p86、pbe1pbe、mpw1k這幾族泛函比較好。基組的話,還是aug-cc-pv?z、mg3s好一些。其實劈裂價鍵基組也不錯,但是必須加「大彌散」和「高角動量」,因為氫鍵還是比較弱一些,氫鍵對應的波函數必須加大離域程度。
其實氫鍵還算是一個比較好算的東西。流行的DFT中,除了OLYP和O3LYP之外,基本都有一定精度。氫鍵的計算,基組的選擇影響大一些,大彌散基組是必須的。
雖然dft在研究氫鍵方面也一直有人在用,但現在大多數的審稿人總是對這種方法持懷疑的態度,因為對擴散相互作用,dft無法預測,而審稿人更為信任的是mp2,而且一般需要大基組來計算,如aug-cc-pvdz,aug-cc-pvtz等,但如果無法完成這些基組,一些低一些的基組來做計算也是可以被接受的,如6-31G++(d,p),6-311G++(d,p)等,但bsse校正是做氫鍵方面一個必須要做的一部分。如aug-cc-pvdz,aug-cc-pvtz等這些大基組,bsse似乎影響不大,可以不做。
3遠程弱作用
遠程作用就比較扯淡了。B3交換泛函徹底完蛋。雖然我主要也是B3LYP陣營的人,但是要我在這個領域誇誇B3LYP,我還真不能瞪著眼睛說瞎話。這個領域DFTB和DFTB+曾經試圖在這個領域做些貢獻,但是成就並不是很大。比較成功的是DFT-D,包括b97-d,b2plyp-d等等這些加上dispersion項的DFT了。
Truhlar的泛函 M05, M05-2X, M06, M06-2X等等可能只適用於某些體系,對於有些體系,照樣給出糟糕的結果。LDA居然能出乎意料地給出vdW作用,而其他GGA泛函都不行。這應該是個偶然,可能是正負誤差相消的結果。比如,用LDA優化出的石墨層間距和實驗值符合得相當好。PBE-D方法總是傾向於高估vdW作用。
遠程作用還有別的選擇——盡管它會大大增加計算量
一種選擇,使用MPn,還是不夠准
另一種選擇,是把MPn改造成SCF-MPn,計算量忒大
再一種選擇,使用CCSD(t)之類的,……呃,還是算了吧,計算量我更受不了。
文獻常見的高斯09的方法有:MPW1KCIS,MPW1B95,MPWB1K,jiewei先生推薦基組tzv(2d,2p)/QZV3P。MS的話一般用GGA/PEB。
基組問題:算遠程作用必須用極大的基組——這是一句廢話,因為你要讓兩個分子相互作用,那麼它們的波函必須能「夠到對方」才行。從TZV(d),到TZV(d,p),到TZV(2d,2p),到TZV(2df,2pd),到TZV(3d2f,3p2d),……繼續加吧,能加多高,就加多高,算遠程弱作用,您永遠別吝嗇你的資源。當然,我絕不反對你使用DZV族
另一個選擇:從6-311++g(d,p),到6-311++g(2d,p),到6-311++g(2df,2pd),到6-311++g(3df,3pd),到6-311++g(3d2f,2p2d),……繼續加呀加呀加呀加!
再來個選擇:從aug-cc-pvtz,到aug-cc-pvdz,到aug-cc-pvqz,……子子孫孫無窮盡也
聽說過一族巨型機組,叫ANO基組,當然還有它的一些變體。ANO規模很巨大,算的能量相當精確,但是對於分子性質沒有那麼好的效果。
4多加一句:關於核磁,給某些人提個醒兒
昨天,有人在qq上問我,他說核磁計算結果與實驗值相差太大。我問他你用啥算的?他說是b3lyp/6-31g*。我直接就無語+仆街了。
很多人習慣用6-31g*。這確實是一個很優秀的基組。但是您居然扛著6-31g*跑去算核磁,誤差不達到百分之一千才怪。算核磁最小的基組,至少要用6-31++g(d,p)。這已經是最低要求了,不能再低了,建議使用6-311++g(2df,2pd)或更高
㈥ 基組什麼詞
「基?」的詞語:
基礎 基於 基本 基業 基地 基金 基調 基石 基因 基層 基準 基點 基督 基腳 基宇
基數 基源 基兆 基址 基建 基楨 基原 基祚 基扃 基命 基圍 基趾 基隆 基圖 基年
基幹 基底 基緒 基岩 基座 基築 基線 基坑 基墌 基面 基床 基階 基陛 基構 基樁
基音 基級 基價 基極 基肥 基波 基頻 基跱 基步 基射 基墟 基網 基團 基禍
「?基」的詞語:
奠基 鎡基 肇基 根基 鴻基 登基 兆基 地基 台基 丕基 元基 厝基 德基 洪基 崇基
創基 福基 茲基 承基 隆基 乾基 開基 天基 路基 劉基 國基 祖基 階基 慶基 成基
羥基 邦基 昌基 本基 宅基 起基 牆基 門基 田基 皇基 重基 長基 阜基 垂基 道基
墉基 羧基 堂基 身基 胡基 靈基 陰基 碭基 樹基 苄基 橋基 壩基 丹基 屋基 鄉基
房基 砧基 硝基 山基 土基 余基 初基 烷基 誕基 盤基 稅基 相基 羰基 禍基 苯基
游基 躡基 遺基 王基 頹基
「基???」的詞語:
基本建設 基本詞彙 基礎教育 基本矛盾 基底動脈 基本粒子
「?基??」的詞語:
桑基魚塘 開基創業 積基樹本 氨基比林 開基立業 阿基米德
「??基?」的詞語:
經濟基礎 保險基金 軍事基地 生產基金 牆高基下 哈剌基酒 轉氨基酶 工業基地
導彈基地 愛斯基摩
㈦ 基本的基組四字成語
開基創業
開基立業
牆高基下
積基樹本
幫助別人真高興!閃人!
㈧ 出字加個偏旁是什麼字然後和基組個詞語
出加上石是個礎字,組成的詞為 基礎
㈨ 基組什麼詞,並造句,造少點.字
基的解釋
[jī]
1. 建築物的根腳:~石。~礎。奠~。
2. 根本的,起始的:~本。~業。回~層。~點。~准。答
3. 根據:~於。
4. 化學上化合物的分子中所含的一部分子原子被看作是一個單位時,稱作「基」:~團。~態。氨~。羧~。
叔叔是基層幹部。