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基組詞語詞

發布時間: 2021-01-11 22:19:06

㈠ gaussian的基組的星號和加號是什麼意思

用iop(3/24=1)可以顯示每個原子實際用的基組,檢查是否設對了;也可以用GFPrint關鍵詞輸出相似內回容,但沒那麼清楚;答也可以用GFInput關鍵詞來輸出實際所用基組,這些信息可以直接作為基組輸入的信息。

㈡ 離子中不同的原子用不同的基組的gaussian輸入文件怎麼寫

(1)對於不同的原子使用不同的基組,可以採用原子編號代替原子來定義。(版2)對於那些看似復雜的權基組可以從一些網站上獲得(選Gaussian基組,再選元素),就可以獲得用iop(3/24=1)可以顯示每個原子實際用的基組,檢查是否設對了;也可以用GFPrint關鍵詞輸出相似內容,但沒那麼清楚;也可以用GFInput關鍵詞來輸出實際所用基組,這些信息可以直接作為基組輸入的信息。

㈢ 關於基組的成語

基 成語 :
開基立業來、源
牆高基下、
積基樹本、
開基創業
開基創業 [kāi jī chuàng yè]
生詞本
基本釋義
指開創帝業。
褒義
出 處
明·羅貫中《三國演義》第44回:「吾等自隨孫將軍開基創業,大小數百戰,方才戰得六郡城池。」

㈣ 高爾基的基組什麼詞

高爾基的復基組什麼詞制 : 基層、 基數、 基因、 地基、 基礎、 基業、 奠基、 基石、 基價、 房基、 羥基、 基建、 根基、 宅基、 登基、 基調、 路基、 基本、 基幹、 基金、 基點、 基線、 基於、 基地、 基督、 基肥、 基準、 稅基、 土基、 基扃、 創基、 天基、 祖基、 基射、 基構、 基墌、 基面、 肇基、 厝基、 基波

㈤ 如何選擇合適的泛函和基組的組合

《什麼樣的泛函和基組的組合,適合做的事情》
這些都是我自己科研經驗和以前讀的文獻的總結。也沒寫什麼參考文獻,就是隨便扯扯,這就全憑自己的經驗和記憶啦,想到哪兒寫到哪兒。這裡面肯定有不對的,甚至有荒謬之極的東西,還請大家指正。也希望自己拋磚引玉,其他高手也講講自己的經驗。

很少見到高手們總結自己的科研經驗和閱覽的文獻。小卒我這個屁股上還沒褪干凈蛋殼的小菜鳥,只好拋出一塊又丑又粗糙的破磚,引引高手們的美玉啦。

以下探討均不涉及cluster。主要是有機化合物、以及金屬離子和有機配體組建成的配合物。其計算也都是基於單個分子的計算。周期體系不在考慮之列——這是一句無奈的詞句,因為我的研究方向不在此處,所以我確實沒有仔細思考過它們

1分子結構、鍵長和鍵角:
對於比較輕的元素,比如CHON之類,b3lyp/6-311++g**就很優秀,如果把基組加到了aug-cc-pv?z的程度,就沒什麼大的必要了。有人甚至說,Cl以前的元素用6-31g就好,如果有孤對電子加個d就行了,如果帶負電荷就加個彌散。

對於一些中等重量的元素,LanL2DZ或者DZVP之類的基組就不錯啦,沒必要加更高的機組了,加了也是浪費。Fe的LanL2DZ有人換成SDD試過,換了以後得到不同基態結果 ,千萬小心使用SDD。第一行過渡金屬,如果只有一個,那麼6-311+g*的計算量還是可以承受的;兩個及兩個以上,非贗勢很難算。lanl2dz和sdd都是比較好的選擇。除非做單點算,否則非要上mp2算就沒太大必要了。

再重一些,比如稀土,LanL2DZ就不行了,M. Dolg先生搞出來的那個基組,斯圖加特RECP的-GTO佔了大部分市場份額。而泛函選擇上,百分之四十用的是B3LYP,百分之四十用的是B3PW91,百分之五用的是MPn族,百分之五用的是CCSD(T)族,百分之五用的是PBE族,百分之五用的是經過改進的半經驗。有時候還要自己選擇,是用小核贗勢呢,還是大核贗勢呢。聽說ADF用PBE/DZPZORA處理稀土,效果也不錯,但是我沒用過。
有金屬的時候,據說tpss不錯,但是我也沒用過,不敢說。

這里我要批一批我偶然見到的一個文獻:Int.J.Electrochem.Sci. 2009, 4, 295-307,伊朗的一群人做的工作。他們居然用6-31G*計算稀土元素,這簡直是扯淡,大家不要學他。

半經驗方法中,處理CHNO之類的元素,AM1和PM3都不錯,PM6也很好,他們可以作為我們前期粗略優化的手段。不過要注意AM1處理共軛體系不太好。有人用Sparkle/AM1和Sparkle/PM3處理稀土元素。精度並不是多麼好,但是極大地減輕了計算量,可以說還是很有成效的一個工作。不過這里不探討半經驗,僅僅探討密度泛函,所以不多說了。

一個例子:3-,我會選擇B3lyp/genecp來優化其分子結構,然後用PBE1PBE/genecp來計算其電子結構。genecp對應關系如下(其實,這個混合基組有自己的專門的名字,叫做LACVP+*)
Fe 0
LanL2DZ
****
C N 0
6-31+g*
****

Fe 0
LanL2DZ

分子結構計算結果的優劣可以用有2種方法加以檢驗,一是與可獲得的實驗數據進行對照(但不要忘了實驗數據本身只是接近事實,而不是准確事實的本身,因為它們仍然是有誤差的),二是在優化結構的基礎上計算性質,同樣的,還是要拿計算結果與更為有限的性質實驗測定結果(它們同樣有誤差)進行對照。這充分體現了人類認識自然規律的有限性——我們總是只能獲得相對真理。由於現有的計算理論本身在處理相關能和相對論效應時有很多困難(理論的和實際計算上的),所以,本人的研究都不涉及重金屬,而只做輕元素體系,多為生物分子體系,大量的計算實驗表明DZP加彌散基組與B3LYP的結合所得的結果可靠,所以一直使用。個人的精力是有限的,無法大量進行方法的嘗試與鑒別,所以,只有大量閱讀文獻來彌補。實際上,就輕元素物質的結構而言,6-31++G**的結果已然非常不錯了,但在計算性質時不妨對基組適當選擇。如前所述,因為實驗有誤差,所以有時實驗並非一定可靠,更重要的是,有的性質的測定,實驗上是不可能進行的(至少目前是如此),因而,計算怎樣走在實驗的前面,恐怕值得思考。
RI-DFT、RI-MP2方法,能比常規方法快一個數量級,但精度接近。此外還有RI-CCSD、RI-CCSD(T)等,不過用得很少。Gaussian 0x的話可以試試純GGA+密度擬合,不會比ADF的同類方法差太多。

2氫鍵

氫鍵的計算,還是以b3lyp、b97-?、pwb6k、b2plyp、b3p86、pbe1pbe、mpw1k這幾族泛函比較好。基組的話,還是aug-cc-pv?z、mg3s好一些。其實劈裂價鍵基組也不錯,但是必須加「大彌散」和「高角動量」,因為氫鍵還是比較弱一些,氫鍵對應的波函數必須加大離域程度。

其實氫鍵還算是一個比較好算的東西。流行的DFT中,除了OLYP和O3LYP之外,基本都有一定精度。氫鍵的計算,基組的選擇影響大一些,大彌散基組是必須的。

雖然dft在研究氫鍵方面也一直有人在用,但現在大多數的審稿人總是對這種方法持懷疑的態度,因為對擴散相互作用,dft無法預測,而審稿人更為信任的是mp2,而且一般需要大基組來計算,如aug-cc-pvdz,aug-cc-pvtz等,但如果無法完成這些基組,一些低一些的基組來做計算也是可以被接受的,如6-31G++(d,p),6-311G++(d,p)等,但bsse校正是做氫鍵方面一個必須要做的一部分。如aug-cc-pvdz,aug-cc-pvtz等這些大基組,bsse似乎影響不大,可以不做。

3遠程弱作用

遠程作用就比較扯淡了。B3交換泛函徹底完蛋。雖然我主要也是B3LYP陣營的人,但是要我在這個領域誇誇B3LYP,我還真不能瞪著眼睛說瞎話。這個領域DFTB和DFTB+曾經試圖在這個領域做些貢獻,但是成就並不是很大。比較成功的是DFT-D,包括b97-d,b2plyp-d等等這些加上dispersion項的DFT了。
Truhlar的泛函 M05, M05-2X, M06, M06-2X等等可能只適用於某些體系,對於有些體系,照樣給出糟糕的結果。LDA居然能出乎意料地給出vdW作用,而其他GGA泛函都不行。這應該是個偶然,可能是正負誤差相消的結果。比如,用LDA優化出的石墨層間距和實驗值符合得相當好。PBE-D方法總是傾向於高估vdW作用。

遠程作用還有別的選擇——盡管它會大大增加計算量
一種選擇,使用MPn,還是不夠准
另一種選擇,是把MPn改造成SCF-MPn,計算量忒大
再一種選擇,使用CCSD(t)之類的,……呃,還是算了吧,計算量我更受不了。
文獻常見的高斯09的方法有:MPW1KCIS,MPW1B95,MPWB1K,jiewei先生推薦基組tzv(2d,2p)/QZV3P。MS的話一般用GGA/PEB。

基組問題:算遠程作用必須用極大的基組——這是一句廢話,因為你要讓兩個分子相互作用,那麼它們的波函必須能「夠到對方」才行。從TZV(d),到TZV(d,p),到TZV(2d,2p),到TZV(2df,2pd),到TZV(3d2f,3p2d),……繼續加吧,能加多高,就加多高,算遠程弱作用,您永遠別吝嗇你的資源。當然,我絕不反對你使用DZV族
另一個選擇:從6-311++g(d,p),到6-311++g(2d,p),到6-311++g(2df,2pd),到6-311++g(3df,3pd),到6-311++g(3d2f,2p2d),……繼續加呀加呀加呀加!
再來個選擇:從aug-cc-pvtz,到aug-cc-pvdz,到aug-cc-pvqz,……子子孫孫無窮盡也
聽說過一族巨型機組,叫ANO基組,當然還有它的一些變體。ANO規模很巨大,算的能量相當精確,但是對於分子性質沒有那麼好的效果。

4多加一句:關於核磁,給某些人提個醒兒
昨天,有人在qq上問我,他說核磁計算結果與實驗值相差太大。我問他你用啥算的?他說是b3lyp/6-31g*。我直接就無語+仆街了。
很多人習慣用6-31g*。這確實是一個很優秀的基組。但是您居然扛著6-31g*跑去算核磁,誤差不達到百分之一千才怪。算核磁最小的基組,至少要用6-31++g(d,p)。這已經是最低要求了,不能再低了,建議使用6-311++g(2df,2pd)或更高

㈥ 基組什麼詞

「基?」的詞語
基礎 基於 基本 基業 基地 基金 基調 基石 基因 基層 基準 基點 基督 基腳 基宇
基數 基源 基兆 基址 基建 基楨 基原 基祚 基扃 基命 基圍 基趾 基隆 基圖 基年
基幹 基底 基緒 基岩 基座 基築 基線 基坑 基墌 基面 基床 基階 基陛 基構 基樁
基音 基級 基價 基極 基肥 基波 基頻 基跱 基步 基射 基墟 基網 基團 基禍

「?基」的詞語:
奠基 鎡基 肇基 根基 鴻基 登基 兆基 地基 台基 丕基 元基 厝基 德基 洪基 崇基
創基 福基 茲基 承基 隆基 乾基 開基 天基 路基 劉基 國基 祖基 階基 慶基 成基
羥基 邦基 昌基 本基 宅基 起基 牆基 門基 田基 皇基 重基 長基 阜基 垂基 道基
墉基 羧基 堂基 身基 胡基 靈基 陰基 碭基 樹基 苄基 橋基 壩基 丹基 屋基 鄉基
房基 砧基 硝基 山基 土基 余基 初基 烷基 誕基 盤基 稅基 相基 羰基 禍基 苯基
游基 躡基 遺基 王基 頹基

「基???」的詞語:
基本建設 基本詞彙 基礎教育 基本矛盾 基底動脈 基本粒子

「?基??」的詞語:
桑基魚塘 開基創業 積基樹本 氨基比林 開基立業 阿基米德

「??基?」的詞語:
經濟基礎 保險基金 軍事基地 生產基金 牆高基下 哈剌基酒 轉氨基酶 工業基地
導彈基地 愛斯基摩

㈦ 基本的基組四字成語

開基創業
開基立業
牆高基下
積基樹本
幫助別人真高興!閃人!

㈧ 出字加個偏旁是什麼字然後和基組個詞語

出加上石是個礎字,組成的詞為 基礎

㈨ 基組什麼詞,並造句,造少點.字

基的解釋
[jī]
1. 建築物的根腳:~石。~礎。奠~。
2. 根本的,起始的:~本。~業。回~層。~點。~准。答
3. 根據:~於。
4. 化學上化合物的分子中所含的一部分子原子被看作是一個單位時,稱作「基」:~團。~態。氨~。羧~。

叔叔是基層幹部。

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